【ひみつの場所】

DQ3（HD-2D版）

HD-2D版の新要素で、町やダンジョン、ほこらのいずれにも該当しないスポット。
位置づけとしては、3DS版DQ11・DQ11Sの2Dモードにある【かくれスポット】と似ているか。
　
フィールド上に高い木や大きな岩などによる目印が点在し、そこに行くとひみつの場所に入ることができる。中には【はぐれモンスター】がいたり、アイテムの入った【宝箱】・【壷】・【樽】・【袋】があったりする。
ひみつの場所には草原、森林、山岳、砂漠、雪原といったタイプがあるが、木や岩などのオブジェクトとアイテム、はぐれモンスターの配置は場所ごとに異なっている。
海洋にも存在し、それらは船に乗って岩礁や氷河のそばで決定ボタンを押すことでのみ立ち入れる。
敵モンスターとのエンカウントは発生せず、【トラップモンスター】が潜んでいることもない。また、【地図】は存在しない。
【ルーラ】で来ることはできない。
　
序盤に登場するひみつの場所には人がいることもあり、はぐれモンスターについてのヒントが聞けたりする。ひみつの場所のキャラの台詞を記憶した場合、【おもいで】コマンドでは場所が「その他」となる。
　
【ちいさなメダル】が落ちていることもあるが、その多くは何の目印もない地面に埋まっているため、【レミラーマ】なしで見つけるのは困難。中にはフィールドへの切り替え地点ギリギリに落ちていて取りづらいマップもある。
　
なお従来版でシンボルの無いスポット（怪しげな場所）だったものは、今回はフィールドから外観が分かるようになっており、旧【精霊の泉】を除いてひみつの場所には該当しない。

一覧

「アイテム数」は【とうぞくのはな】および【レミラーマ】で反応する数。●はちいさなメダルが手に入ることを示す。
太字ははぐれモンスター。★は保護するのに【ラーのかがみ】が必要。

上の世界（地上）

上の世界（海洋）

入るには船が必要となる。ちいさなメダルは無い。

上の世界（高台など）

訪れるにはラーミアが必要となる。

アレフガルド・天界

【エンディング】内では入ることができなくなり、ただのオブジェとなる。